La Dirección de Aseguramiento de la Calidad está adscrita a la Rectoría de la Sede Principal Bogotá y la conforman: la coordinación del Sistema Integrado de Gestión (calidad, ambiental y SST), la coordinación de Calidad Académica y la Coordinación de Gestión de la Información.

El objetivo de esta Dirección es consolidar el Sistema Institucional de Aseguramiento de la Calidad de la Universidad Santo Tomás, Sede Principal Bogotá, a través del liderazgo, acompañamiento y apoyo a los programas académicos, así como a las áreas académicas y administrativas, para el cumplimiento de los procesos establecidos por el Ministerio de Educación Nacional, las normas internacionales ISO, el Proyecto Educativo Institucional y la planeación estratégica de la Universidad. Todo ello soportado por la gestión y el análisis de la información para la toma de decisiones.